Определение мутаций ключевых онкогенов, включая фармакогенетические маркеры токсичности химиотерапии (42 гена), методом NGS

Анализ позволяет исследовать гены, ассоциированные с развитием рака лёгкого, желудка, прямой кишки, некоторых отделов толстой кишки (ободочной кишки и ректосигмоидного отростка), жёлчевыводящих путей, уротелиального и билиарного рака, меланомы кожи, рака слизистых оболочек, опухоли с невыявленной первичной локализацией, а также подобрать прицельные (таргетные) препараты с учётом генетических особенностей, от которых зависит эффективность и токсичность терапии.

Зачем сдавать этот анализ?

Показания к исследованию:

1. Диагностированный рак — для уточнения диагноза и прогноза, а также для выбора оптимальной тактики лечения, когда: а) существует несколько вариантов прицельной (таргетной) терапии; б) перестала помогать терапия, назначенная на основании клинических стандартов; в) отсутствует единый стандарт лечения или для имеющейся клинической картины стандарты лечения не определены.
2. Оценка эффективности и токсичности лекарственных препаратов, используемых для химиотерапии.

Подробное описание исследования

Онкогены и фармакогенетические маркеры токсичности химиотерапии Особенности и преимущества методики Источники

Онкогены и фармакогенетические маркеры токсичности химиотерапии

Онкогены — один из типов генов, которые могут приводить к развитию раковых заболеваний. В норме они кодируют различные белки, регулирующие функции клеток. Однако при «поломке» такого гена происходит злокачественное перерождение клеток и формируется опухоль.

Некоторые онкогены чаще других приводят к развитию онкологического заболевания — их можно условно назвать ключевыми. К ним относятся гены, ассоциированные с раком следующих органов-мишеней:

• лёгких;
• кожи и слизистых оболочек;
• жёлчного пузыря;
• жёлчевыводящих путей;
• прямой кишки;
• ободочной кишки и ректосигмоидного отростка (отделы толстой кишки);
• желудка;
• мочевого пузыря;
• мочевыводящих путей.

Для терапии рака разработаны разные классы препаратов. Их эффективность определяется тем, какие именно мутации привели к заболеванию, поэтому определение генетических «поломок» играет важную роль при выборе терапии и прогнозе лечения.

Однако препараты, используемые для лечения онкологических заболеваний, обладают токсичностью и могут негативно влиять на здоровые органы и системы. Поэтому, помимо поиска конкретной мутации, вызвавшей рак, значительную роль в терапии заболевания играет понимание об индивидуальной реакции организма на химиотерапию.

Реакция зависит от небольших вариаций последовательности ДНК в генах, которые кодируют белки, участвующие в метаболизме препаратов или служащие их мишенями. Такие гены называют фармакогенетическими маркерами токсичности химиотерапии.

Имея информацию о мутациях в этих генах, можно более точно предсказать, какое воздействие окажет лекарственный препарат, а следовательно, повысить эффективность и снизить токсичность проводимой терапии.

В ходе теста исследуются гены BRAF, EGFR, ERBB2, KIT, KRAS, NRAS, PDGFRA, PIK3CA, PTEN, TP53, UGT1A1, AKT1, AKT2, AKT3, ALK, ARAF, ERBB3, ERBB4, ESR1, FGFR1, FGFR2, FGFR3, FGFR4, H3F3A, HIST1H3B, HIST1H3C, HIST2H3C, HRAS, IDH1, IDH2, MET, STK11, RAC1, RAF1, RIT1, ROS1, FCGR2A, FCGR3A, TERT, фармакогенетические маркеры токсичности химиотерапии CYP2D6, DPYD, G6PD, а также MSI.

Особенности и преимущества методики

Тест позволяет выполнить анализ генов по технологии NGS на мутации, ассоциированные с развитием распространённых видов рака, а также влияющие на эффективность и токсичность терапии.

NGS (next generation sequencing) — секвенирование нового поколения. Метод NGS позволяет «прочитать» последовательность генов и однозначно судить, есть ли в ней изменения. Преимущество методики заключается в том, что с помощью NGS-исследования можно выявлять одновременно несколько маркеров онкологического заболевания.

По результатам теста человеку с онкологическим диагнозом могут подобрать прицельные (таргетные) препараты с учётом специфики его опухоли и реакции организма на воздействие лекарств. Исследование также используется, чтобы контролировать эффективность химиотерапии.

Для тестирования используется биопсийный материал. При его исследовании можно обнаружить как наследственные, так и приобретённые мутации.

Источники

1. Злокачественное новообразование бронхов и лёгкого : клинические рекомендации / . Ассоциация онкологов России, Российское общество клинической онкологии. 2021.
2. Злокачественные новообразования ободочной кишки и ректосигмоидного отдела : клинические рекомендации / Ассоциация онкологов России, Российское общество клинической онкологии. 2020.
3. NCCN Guidelines for patients: Colon cancer. 2018.

Подготовка к исследованию

Специальной подготовки не требуется.

В Лаборатории взятие биопсийного материала не производится. Принимается только принесённый биоматериал.

Интерпретация результата

Результат одного исследования не может служить достаточным основанием для постановки диагноза или назначения лечения. Решение об этом должен принимать врач на основании всех имеющихся у него данных.

Референсные значения

Мутаций не обнаружено.