Анализ микробиоты по Осипову (биотоп пристеночная микробиота

Анализ направлен на определение состава микробиоты, обитающей на слизистой оболочке толстой кишки. Исследование является одним из методов выявления изменений кишечной флоры и оценки ее восстановления на фоне терапии пробиотиками.

Зачем сдавать этот анализ?

1. Подозрение на нарушение состава микрофлоры толстой кишки при заболеваниях пищеварительной системы;
2. Оценка изменений кишечной микробиоты на фоне терапии антибиотиками, пробиотиками.

Подробное описание исследования

Микробиота толстой кишки представляет собой совокупность всех микроорганизмов, населяющих этот отдел желудочно-кишечного тракта. Она включает в себя бактерии, вирусы, грибы. Из-за различий в составе микробиоты, обитающей в просвете кишечника или на слизистой оболочке органа, принято выделять просветную и пристеночную микрофлору.

Бактерии доминируют среди представителей кишечной микробиоты. Выделяют эубиотические и условно-патогенные виды бактерий. Эубиотические бактерии рассматриваются как полезные. Они преобладают в здоровом кишечнике, где участвуют в следующих процессах:

1. Образование витаминов;
2. Переваривание остатков пищи;
3. Поддержание иммунитета;
4. Обмен холестерина и желчных кислот.

В меньшем количестве в кишечнике обнаруживаются условно-патогенные бактерии. Они поддерживают разнообразие микробиома, что также важно для здоровья.

Неправильное питание, заболевания желудочно-кишечного тракта, прием некоторых антибиотиков нарушает состав микробиоты кишечника. Численность полезных бактерий уменьшается, в то же время наблюдается избыточный рост условно-патогенных микроорганизмов.

Это состояние называют «дисбиоз» (более раннее название «дисбактериоз»). При незначительном нарушении состава микрофлоры толстой кишки описанные изменения незаметны для человека. Увеличение численности условно-патогенной пристеночной микрофлоры приводит к нарушению пищеварения, синтеза витаминов, обмена веществ. Это проявляется в виде вздутия живота, повышенного газообразования, нарушения стула. Длительное изменения микробного состава толстой кишки вносит вклад в повышение риска некоторых заболеваний, например рака кишечника.

Ранее стандартным тестом на нарушение состава микробиоты толстой кишки был посев кала на питательные среды. В связи с тем, что не все виды бактерий могут быть обнаружены подобным методом и большими сроками получения результатов, сейчас данный анализ используется не так широко.

Нашим соотечественником, профессором Г.А. Осиповым, был разработан метод, позволяющий определить состав микрофлоры по наличию белков бактерий в биологическом образце. Для каждого вида микроорганизмов выделен характерный спектр белков.

Анализ выполняется с помощью хромато-масс-спектрометрии (ХМС) на современном оборудовании. Преимущества исследования в высокой точности, скором получении результатов, оценке содержания большого количества микроорганизмов (бактерии, грибы, вирусы).

Источники

1. Осипов, Г.А., Родионов, Г.Г. Микроэкология человека в норме и патологии по данным масс-спектрометии микробных маркеров. Медико-биологические и социально-психологические проблемы безопасности в чрезвычайных ситуациях, 2013. — Т. 2. — С. 43-53.
2. Nandini, E., Arunraj, B., Rajesh, N. et al. Improvised method for urinary p-cresol detection and measurement using high performance liquid chromatography/mass spectrometry. Heliyon, 2019. — Vol. 5(12).
3. Dabur, R., Shirolkar, A., Mishra, V. et al. Non-invasive Qualitative Urinary Metabolomic Profiling Discriminates Gut Microbiota Derived Metabolites in the Moderate and Chronic Alcoholic Cohorts. Curr Pharm Biotechnol., 2017. — Vol 18(14). — P. 1175-1189.

Подготовка к исследованию

В Лаборатории взятие соскоба или биоптата слизистой толстой кишки не производится. Принимается только принесенный биоматериал. Доставьте биоматериал в лабораторное отделение как можно быстрее после сбора, не позднее чем через 2 часа.

Противопоказания и ограничения

Абсолютных противопоказаний нет.

Интерпретация результата

Результаты исследования не являются диагнозом. Их расшифровку проводит только врач с учетом клинической картины заболевания, всех данных о состоянии здоровья человека.

Результаты представлены на бланке в виде списка обнаруженных микроорганизмов. Отдельно будут обозначены отклонения от нормы численности тех или иных представителей пристеночной микробиоты.